lammps并行命令,lammps并行计算
作者:admin 发布时间:2024-10-08 05:18 分类:资讯 浏览:8
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lammps的输出文件有一段没保存
1、重新输出一次。LAMMPS有两种基本的输出,包括热力学输出和dump文件,如果输出结果不全,建议重新输出。LAMMPS是大规模原子分子并行模拟器,主要用于分子动力学相关的一些计算和模拟工作。
2、lammps输出文件输出后会输出到系统运行框中,在运行栏中输入cmd即可打开系统运行框,看到我们的输出文件。dump是LAMMPS最常用的输出命令。
3、第一种是热力学输出,每隔一定的时间步就打印到屏幕和log文件的一列数。第二种是dump文件,包括按照一定的频率写入文件的原子位置快照和各种per-atom数值。每个模拟打印一组热力学输出;可能生成任意数目的dump文件。
4、改变运行次数,用run命令,后面接要运行的次数,如run 1000000 先安装vmd,打开vmd,选择file-new molecule,然后选择你的lammps输出文件。
关于LAMMPS输出(Output)的问题
对应于上面的三大部分,LAMMPS设置了不同的命令,有些命令结合在一起实现相关的功能。 对于断点数据,原始数据,LAMMPS主要有一下命令进行数据的输入输出。
lammps输出文件输出后会输出到系统运行框中,在运行栏中输入cmd即可打开系统运行框,看到我们的输出文件。dump是LAMMPS最常用的输出命令。
重新输出一次。LAMMPS有两种基本的输出,包括热力学输出和dump文件,如果输出结果不全,建议重新输出。LAMMPS是大规模原子分子并行模拟器,主要用于分子动力学相关的一些计算和模拟工作。
类型sc or bcc or fcc or hcp or diamond属于三维问题。类型sq or sq2 or hex属于二维问题。类型custom既可以用于二维,也可以用于三维问题。
Lammps入门手册
这个...感觉Lammps入门还是要有段时间的,不过我个人不是很擅长学新的东西。命令的话不要去背,太多了。
lammps并行安装和非并行安装的区别
而且lammps感觉通常是给unix系统跑得,windows的话虽然有对应版本,但并行好不好用就不清楚了。
必须的,记住安装路径,编译lammps时要修改makefile.g++文件,需要用到fftw和mpich的路径。另外系统还要安装g++,或者,直接安装build-essential也行。fftw最好用2-5版本的,mpich也用2-5版本的。
LAMMPS可以支持包括气态,液态或者固态相形态下、各种系综下、百万级的原子分子体系,并提供支持多种势函数。且LAMMPS有良好的并行扩展性。
各位前辈好,我使用的是 Makefile.mkl。
在并行环境中,LAMMPS采用空间分解策略,将模拟空间划分为无数个小的三维区域,每个区域分配给一个处理器处理,同时通过通信共享边界上的ghost原子信息,确保整个模拟过程的流畅进行。
可以,如果系统安装了mpich,lammps进行并行计算,多增加一个算例,计算时间就多一倍,如果是单线程的lammps,那么你可以算N(计算机核数或线程数)个算例而不影响速度。
lammps该怎么入门?
1、首先看你题目做那个方向,做传热相关还是力学相关? 那种材料?材料的势能场参数很关键,要确保能有好的势能参数,输到Lammps里头才能跑出好结果。然后要先从例子开始。
2、如果你的盒子是周期性的,并且在某个方向上盒子的尺寸是晶格距离的整数倍,那么LAMMPS会在边界上只放置一个原子(译注:边界上的原子不会丢失或在两个面同时出现)。
3、这个应该只是定义了一个变量,名字叫latparam(我猜应该是lattice parameter的缩写),该变量的值为05。我猜05应该对应某种材料的晶格常数。
4、更改lammps系宗,改成(2)热流结果正常,如下图 沿着温度梯度方向的热流值趋于恒定。新问题:对于热导率较低的case,出现了热浴和冷浴能量不守恒的问题。
关于lammps并行命令和lammps并行计算的介绍到此就结束了,不知道你从中找到你需要的信息了吗 ?如果你还想了解更多这方面的信息,记得收藏关注本站。
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